2012年1月18日，北京正负电子对撞机重大改造工程研究集体获2011年中国科学院杰出科技成就奖。

　　2012年1月21日，詹文龙副院长慰问北京正负电子对撞机运行值班人员。

　　2012年2月10日，召开BEPCII直线加速器运行研讨会。本次会议针对BEPCII直线加速器运行中遇到的问题和观测到的现象，讨论和分析了影响稳定可靠运行的原因，提出了改进措施和以及对资源的需求。

　　2012年2月24日，北京正负电子对撞机（BEPC）国家实验室新一届领导班子成立。

　　2012年2月29日至3月3日，2012年BESIII国际合作组物理及软件研讨会顺利召开。

　　2012年3月21日，高能所与院图联合举办“走近北京正负电子对撞机”科普展览。

　　2012年4月5日至6日，院大科学装置运行经费审核专家组来高能所实地审核。

   2012年5月22日16时，BEPCII/BESIII单轮运行获取10个亿J/Ψ事例,为在J/Ψ能区早出物理成果奠定了坚实的基础。本次BEPCII在J/Ψ能量上运行40余天即获得了10.3亿事例，相比BEPC/BESII在1999-2001两个运行年度总共获得5800万J/Ψ事例，BEPCII/BESIII的性能有了极大提高。

　　2012年6月9日至13日，BESIII国际合作组2012年春季会议在苏州大学召开。

　　2012年6月21日-7月27日，2012年BSRF第一次开放运行顺利结束，BSRF为用户提供了785.97小时的有效机时，共有251个研究课题开展了同步辐射实验。用户来自国内91个研究机构和国外2个研究单位，其中，国内的研究机构包括中科院28个研究所、教育部51所大学和其他12个科研单位。

　　2012年6月21日至7月27日，北京-试验束顺利完成2012年度第一轮运行任务，试验束装置利用电子直线加速器束流打靶产生的次级粒子（电子，质子，π介子），为用户提供探测器刻度试验专用束流。

　　2012年8月16日至19日，BEPC第十七届年会暨ADS学术研讨会圆满召开,来自高能所以及中国科学技术大学国家同步辐射实验室、中国科学院近代物理研究所、中国科学院上海应用物理研究所和其它相关合作单位的120余位代表参加了会议。

　　2012年7月27日至9月1日，BEPCII通用设施夏季检修工作全面完成。

　　2012年8月21日至24日，2012年北京同步辐射装置用户学术年会暨专家会圆满召开,这次年会的召开，既肯定了BSRF长期以来作为我国北方地区主要大科学装置的重要支撑作用，又对BSRF未来的发展提出了新的要求和希望，不仅要继续提高运行开放的质量，发展先进的实验技术和方法，还要扩大用户的群体，进一步提高用户的实验技术水平。

　　2012年9月13日、9月26日，受国家发展改革委员会委托，上海投资咨询公司组织相关专家对中国科学院高能物理研究所建成的北京正负电子对撞机重大改造工程（BEPCII）进行了后评价。

　　2012年9月16日至10月30日，BEPCII完成第二轮同步辐射供光运行。

　　2012年10月8日至31日，北京-试验束顺利完成试验束升能调试（由1.89GeV运行升能到2.5GeV运行）暨2012年度第二轮运行工作。

　　2012年11月25日至29日，BESIII国际合作组2012年冬季合作组会议在广西师范大学召开,来自全球50个合作单位的近200名代表出席了会议。

　　2012年12月26日，BEPC国家实验室第四届学术委员会第一次全体会议在高能所举行。